Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM3Q53FZ2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms