Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms