Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIK1Q3SY52 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms