Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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