Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HADHQ16836 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HADHQ16836 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HADHQ16836 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms