Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms