Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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