Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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