Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ITSN1Q15811 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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