Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF4Q15306 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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