Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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