Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms