Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARHGEF6Q15052 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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