Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3GAP1Q15042 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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