Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSME4Q14997 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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