Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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