Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms