Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPARCL1Q14515 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPARCL1Q14515 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms