Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCOA4Q13772 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms