Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALCAMQ13740 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALCAMQ13740 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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