Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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CDH18Q13634 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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CDH18Q13634 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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CDH18Q13634 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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CDH18Q13634 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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CDH18Q13634 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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CDH18Q13634 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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CDH18Q13634 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDH18Q13634 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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