Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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