Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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