Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATRQ13535 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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