Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PICALMQ13492 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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