Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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