Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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