Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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