Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RESTQ13127 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RESTQ13127 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RESTQ13127 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms