Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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