Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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