Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNIP3Q12983 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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