Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP53BP1Q12888 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms