Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STX4Q12846 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STX4Q12846 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms