Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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