Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWF1Q12792 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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