Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGEF5Q12774 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGEF5Q12774 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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