Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms