Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms