Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CD164Q04900 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms