Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms