Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms