Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms