Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLTCQ00610 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms