Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms