Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms