Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP1P63208 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP1P63208 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKP1P63208 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKP1P63208 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP1P63208 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP1P63208 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP1P63208 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP1P63208 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP1P63208 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP1P63208 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms