Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CABP4P57796 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CABP4P57796 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms