Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRG3P56975 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG3P56975 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG3P56975 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms