Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPTEP56180 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPTEP56180 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms